{"id":14223,"date":"2020-04-08T16:21:00","date_gmt":"2020-04-08T14:21:00","guid":{"rendered":"https:\/\/autoestrada.ch\/l-epfl-fournit-de-la-puissance-de-calcul-contre-le-coronavirus\/"},"modified":"2021-08-25T14:59:35","modified_gmt":"2021-08-25T12:59:35","slug":"l-epfl-fournit-de-la-puissance-de-calcul-contre-le-coronavirus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/autoestrada.ch\/fr\/l-epfl-fournit-de-la-puissance-de-calcul-contre-le-coronavirus\/","title":{"rendered":"L&rsquo;EPFL fournit de la puissance de calcul contre le coronavirus"},"content":{"rendered":"<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Lanc\u00e9 il y a presque vingt ans, le projet international Folding@home invite des volontaires \u00e0 mettre \u00e0 disposition des ressources informatiques pour simuler la dynamique des prot\u00e9ines. Fin f\u00e9vrier, Folding@home a annonc\u00e9 qu\u2019il s\u2019appliquait \u00e0 g\u00e9n\u00e9rer des simulations pour comprendre comment le coronavirus infecte des cellules, et comment le virus pourrait \u00eatre vaincu.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Amir Zamir, professeur \u00e0 la Facult\u00e9 informatique et communications (IC) de l\u2019EPFL, a amorc\u00e9 la contribution de l\u2019EPFL \u00e0 Folding@home avec un de ses \u00e9tudiants, Alexander Sax, qui connaissait d\u00e9j\u00e0 le projet. Gr\u00e2ce \u00e0 l\u2019ing\u00e9nieur syst\u00e8me Yoann Moulin et \u00e0 l\u2019informaticien Carlos Perez du service informatique de l\u2019IC (SIFAC), l\u2019EPFL a engag\u00e9 jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent 100 processeurs graphiques (GPU) 32\u00a0Go de centres de donn\u00e9es pour le projet Folding@home, ce qui constitue une \u00abcontribution importante\u00bb selon Amir Zamir.<\/p><div class=\"autoestrada-nel-contenuto autoestrada-entity-placement\" id=\"autoestrada-2176754022\" style=\"position: relative;padding: 30px;border: 2px solid red;margin: 25px auto 35px;text-align: center;width: fit-content;\"><div class=\"autoestrada-adlabel\">Annonce<\/div><div id=\"autoestrada-1333041563\"><!-- START ADVERTISER: from tradedoubler.com -->\r\n<script type=\"text\/javascript\">\r\nvar uri = 'https:\/\/impfr.tradedoubler.com\/imp?type(img)g(25401758)a(2263928)' + new String (Math.random()).substring (2, 11);\r\ndocument.write('<a href=\"https:\/\/clk.tradedoubler.com\/click?p=320153&a=2263928&g=25401758\" target=\"_BLANK\"><img src=\"'+uri+'\" border=0><\\\/a>');\r\n<\/script>\r\n<!-- END ADVERTISER: from tradedoubler.com -->\r\n<\/div><\/div>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">A la suite de la fermeture temporaire du campus de l\u2019EPFL le 16\u00a0mars \u00e0 cause du coronavirus, les ordinateurs des classes et des laboratoires n\u2019\u00e9taient plus utilis\u00e9s. Le SIFAC a donc mis \u00e0 disposition certaines de ces unit\u00e9s pour contribuer aux simulations.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Simulation de solutions<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Pour les prot\u00e9ines, la forme correspond \u00e0 la fonction. Leurs structures complexes multicouches compos\u00e9es de cha\u00eenes d\u2019acides amin\u00e9s leur conf\u00e8rent des propri\u00e9t\u00e9s sp\u00e9cifiques et leur permettent d\u2019effectuer des t\u00e2ches biologiques. D\u00e9couvrir comment les prot\u00e9ines se replient sur elles-m\u00eames pour former leur structure finale est un \u00e9l\u00e9ment cl\u00e9 pour comprendre de nombreuses maladies. Cela signifie que les simulations de prot\u00e9ines constituent des ressources pr\u00e9cieuses que les scientifiques peuvent utiliser pour comprendre comment des agents pathog\u00e8nes tels que des virus infectent leurs h\u00f4tes, et pour identifier des faiblesses que des th\u00e9rapies cibl\u00e9es pourraient exploiter.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Toutefois, ces simulations n\u00e9cessitent de la puissance de calcul \u2013 beaucoup de puissance de calcul. Folding@home mobilise des ressources informatiques pour comprendre comment une prot\u00e9ine situ\u00e9e sur l\u2019enveloppe d\u2019une cellule de coronavirus, appel\u00e9e prot\u00e9ine de spicule, interagit avec un r\u00e9cepteur d\u2019une cellule pulmonaire. Cette information peut aider des scientifiques \u00e0 mettre au point ce qu\u2019on appelle des anticorps th\u00e9rapeutiques, qui interviennent entre le r\u00e9cepteur et la prot\u00e9ine de spicule, emp\u00eachant l\u2019infection. De tels anticorps ont d\u00e9j\u00e0 \u00e9t\u00e9 cr\u00e9\u00e9s pour le SARS-CoV, et serviront de mod\u00e8le pour essayer de simuler le coronavirus.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Gr\u00e2ce aux efforts conjugu\u00e9s de volontaires comme ceux de l\u2019EPFL, Folding@home a r\u00e9cemment atteint un exaflop de puissance de calcul, ce qui le place devant certains superordinateurs les plus rapides au monde.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">La technologie au service du bien<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Au 6 avril, le SIFAC avait effectu\u00e9\u00a0plus de 8500\u00a0unit\u00e9s de travail de Folding@home\u00a0(une mesure de la contribution au projet de simulation du coronavirus) en deux semaines, ce qui le place parmi les 50\u00a0meilleurs contributeurs quotidiens sur pr\u00e8s de 250\u00a0000.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">\u00abOn peut sans autre dire que l\u2019EPFL est l\u2019un des principaux contributeurs acad\u00e9miques, si ce n\u2019est le principal, en termes de puissance de calcul pour le projet de Folding@home en lien avec le coronavirus\u00bb, souligne Amir Zamir, en faisant r\u00e9f\u00e9rence \u00e0 la position du SIFAC dans le classement quotidien du projet.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Outre la facult\u00e9 IC, on compte parmi les participants de l\u2019EPFL \u00e0 Folding@home une \u00e9quipe d\u2019\u00e9tudiants ainsi que l\u2019\u00e9quipe de l\u2019Informatique scientifique et support applicatif de l\u2019EPFL (SCITAS). Selon son directeur Gilles Fourestey, SCITAS met \u00e0 disposition les cycles de processeurs (CPU) vides de ses clusters, et il ainsi effectu\u00e9 quelque 2500\u00a0unit\u00e9s de travail avec plus de 90 processeurs actifs.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Amir Zamir ajoute que la mise \u00e0 disposition d\u2019une telle quantit\u00e9 de puissance de calcul par une institution acad\u00e9mique est un bel accomplissement.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">\u00abOn trouve peu d\u2019universit\u00e9s dans la liste des contributeurs \u00e0 Folding@home, ce qui montre que la majorit\u00e9 des ressources informatiques se trouvent dans la branche industrielle. Toutefois, l\u2019EPFL fait exception, et cela t\u00e9moigne du fait que nous poss\u00e9dons d\u2019excellentes ressources informatiques, d\u2019un niveau industriel.\u00bb<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">L\u2019\u00e9quipe de projet souligne cependant que cela va au-del\u00e0 des chiffres.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">\u00abCe qui nous motive, c\u2019est l\u2019id\u00e9e de la technologie au service du bien, et le fait qu\u2019une institution telle que l\u2019EPFL peut vraiment donner quelque chose en retour \u00e0 la soci\u00e9t\u00e9\u00bb, pr\u00e9cise Martial Challandes, responsable informatique.<\/p>\n<p style=\"margin-bottom: 0cm;\">Source: EPFL<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Lanc\u00e9 il y a presque vingt ans, le projet international Folding@home invite des volontaires \u00e0 mettre \u00e0 disposition des ressources informatiques pour simuler la dynamique des prot\u00e9ines. 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